真菌（fungus）
具有真正细胞核，能产生孢子而没有叶绿素，一般都能进行有性和无性繁殖，常具分枝的丝状营养体。种属很多，已报道的属达1万以上,种超过10万个。真菌一词的拉丁文(fungus)原意蘑菇。真菌是一个古老的生物类群,在泥盆纪(4亿多年前)的第一批化石植物中，就有腐生和寄生的真菌。
真菌的起源和演化众说纷纭，但直到现在还没有一个能被真菌学家们普遍接受的学说。一个学派认为真菌是由藻类演化而来。这些藻类因丧失色素而从自养变成异养，生理的变化引起了形态的改变。他们根据性器官的形态和交配方式进行推测，认为鞭毛菌来自绿藻，接合菌来自接合藻，子囊菌来自红藻，担子菌来自子囊菌。另一个学派认为除卵菌来自藻类外，其余的真菌来自原始鞭毛生物。鞭毛生物水生，具有一至数根鞭毛，有的含叶绿素或红色素，有的含其他色素或无色素。含叶绿素的演化为藻,无色素的演化为菌。20世纪中叶以前,有关真菌系统发育的设想、方案和系统树，除生态习性和营养方式外，主要是以形态学为基础。现在人们普遍认识到多数活有机体的基础生物化学是相同的，而其差异如细胞壁的组分、DNA和RNA的含量、DNA中的G+C克分子百分含量、氨基酸的排列顺序、血清反应以及某些代谢产物的含量与合成途径等，则有利于确定它们之间的亲缘关系。例如，根据血清反应，推测藻状菌是管藻目中靠近无隔藻的两个早期分支,后来又衍生出许多支系,直至今天的炭角菌、羊肚菌、锈菌、鸟巢菌、牛肝菌，鹅膏菌等类群。再如，根据赖氨酸的生物合成途径，推测壶菌可能是从与眼虫藻有关的鞭毛生物演化而来。壶菌丧失鞭毛以后，由于菌丝发达而演化成接合菌，从接合菌再演化为子囊菌和担子菌。所以，真菌的演化途径可能是：与眼虫藻有关的鞭毛生物→壶菌→接合菌→子囊菌→担子菌。这是真菌演化的主轴，相当于绿色植物中的：绿藻→轮藻→苔藓→维管束植物。过去认为卵菌是在产生高等真菌的演化线上的一个早期分支，现在却认为它属于另一个演化线，大概起源于与金藻有关的无色素类型，因而被排除在真菌以外。
真菌分类系统很多，现仅根据英国真菌学家G.C.安斯沃思等人(1971,1973)制订的系统，将真菌界分为2门、5亚门、20纲。
